(相關資料圖)
記者13日從中國科學技術大學了解到,該校生命科學與醫(yī)學部瞿昆教授課題組和合肥微尺度物質科學國家研究中心王志凱特任研究員團隊合作,揭示了細胞有絲分裂期轉錄調控動態(tài)機制。相關研究成果日前發(fā)表于《科學進展》。
研究方案示意圖。中國科大供圖
細胞在進入有絲分裂時,通常伴隨著染色質的逐漸固縮和基因轉錄的顯著減少,而當細胞退出有絲分裂時,子細胞的染色質狀態(tài)和基因轉錄又逐漸被重新激活。在整個過程中,細胞的染色質狀態(tài)是如何動態(tài)變化的,又存在什么樣的關鍵轉錄調控,探究這些問題對于理解有絲分裂期“轉錄記憶”的傳遞具有重要意義。
研究團隊繪制了來自有絲分裂不同時期的6538個L02胎肝細胞的高質量染色質可及性圖譜,并通過假時間軌跡、多組學整合、原位成像、轉錄因子擾動等干濕結合的分析策略系統(tǒng)性探究了有絲分裂期染色質狀態(tài)和轉錄調控的動態(tài)變化。
研究人員首先通過假時間軌跡分析構建了有絲分裂時間軸,發(fā)現(xiàn)染色質可及性在細胞進入有絲分裂期后持續(xù)降低并在中期之后開始增加?;谠撌状蚊枥L的有絲分裂期染色質狀態(tài)動態(tài)變化圖譜,研究人員發(fā)現(xiàn)7%的染色質區(qū)域在該過程中始終保持活躍狀態(tài),并將其定義為書簽區(qū)域。進一步分析發(fā)現(xiàn),書簽區(qū)域是多種細胞類型共有的表觀遺傳特征,其主要位于基因啟動子區(qū)域,并且染色質狀態(tài)的活躍程度與基因激活速率顯著正相關,這些結果決定了管家基因在有絲分裂后的首先被激活。
接下來,研究人員發(fā)現(xiàn)靶向書簽區(qū)域的轉錄因子比細胞類型特異性轉錄因子更早地結合染色質,這種轉錄因子與染色質的動態(tài)相互作用決定了基因重激活的動態(tài)過程。
該研究揭示了有絲分裂期細胞染色質可及性先減少后增加的動態(tài)變化和作為“轉錄記憶”載體始終活躍的染色質可及區(qū)域,發(fā)現(xiàn)了大規(guī)模轉錄因子與染色質的動態(tài)相互作用過程,從中鑒定了新的調控基因重激活的轉錄因子NF-YA,從而構建整個有絲分裂期轉錄調控網(wǎng)絡的動態(tài)演變過程。