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近日,中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所聯(lián)合國(guó)內(nèi)科研單位成功開發(fā)新型DNA斷裂檢測(cè)技術(shù)(DEtail-seq)。該技術(shù)能夠在多個(gè)物種中高效地檢測(cè)減數(shù)分裂DNA雙鏈斷裂位點(diǎn)的3’末端,是一種接近單核苷酸水平的超高分辨率全基因組DNA斷裂位點(diǎn)檢測(cè)方法。利用此技術(shù),研究人員成功繪制了釀酒酵母、小鼠和人類的減數(shù)分裂DNA雙鏈斷裂圖譜。相關(guān)研究成果發(fā)表在《中國(guó)科學(xué)—生命科學(xué)(Science China-Life Sciences)》上。
DEtail-seq實(shí)驗(yàn)流程示意圖 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所供圖
在真核生物中,減數(shù)分裂是有性繁殖所需的一個(gè)基本過程,繪制精細(xì)的減數(shù)分裂DNA雙鏈斷裂圖譜,對(duì)人們了解減數(shù)分裂同源重組機(jī)制至關(guān)重要。研究團(tuán)隊(duì)利用單鏈DNA連接體系對(duì)DNA斷裂3’端直接連接測(cè)序接頭,再通過片段化、第二鏈延伸、第二接頭連接等一系列步驟,完成文庫(kù)構(gòu)建,經(jīng)測(cè)序及數(shù)據(jù)分析,獲得DNA斷裂3’端的位置信息。檢測(cè)結(jié)果表明,新型DNA斷裂檢測(cè)技術(shù)分辨率極高,可達(dá)到單核苷酸或接近單核苷酸水平。研究人員利用該技術(shù)在釀酒酵母、小鼠以及人類生殖細(xì)胞中成功檢測(cè)出減數(shù)分裂DNA斷裂的基因組分布,并發(fā)現(xiàn)了減數(shù)分裂DSB的一系列新特征。
該研究得到國(guó)家自然科學(xué)基金、中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院青年創(chuàng)新專項(xiàng)等支持。
關(guān)鍵詞: 減數(shù)分裂 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 單核苷酸 研究人員 釀酒酵母